A FUNPESQ mantém convênio com SEMEC – Secretaria Municipal de Educação e Cultura do Município de Teresina, que atuam na manutenção da Escola Municipal Meio Norte. Possui convênio com faculdades no Estado do Piauí, a FAP TERESINA – FACULDADE PIAUIENSE (CENTRO DE ENSINO SUPERIOR PIAUIENSE LTDA.) e a FAP PARNAÍBA – FACULDADE DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO (SOCIEDADE DE ENSINO SUPERIOR PIAUIENSE LTDA.), como também no Estado do Paraná, com a FAP APUCARANA – FACULDADE DE APUCARANA (CENTRO DE ENSINO SUPERIOR DE APUCARANA.). Também a FUNPESQ faz parte do Conselho de Administração da FUNDAPE – FUNDAÇÃO DE DESENVOLVIMENTO E APOIO À PESQUISA, ENSINO E EXTENSÃO DO PIAUÍ, fundação de apoio e incentivo à UFPI (Universidade Federal do Piauí).
